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ROOTQUANT-SCAN 植物根系表型成像檢測(cè)系統(tǒng)

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    01.ROOTQUANT-SCAN 植物根系表型成像檢測(cè)系統(tǒng)

    RootQuant-Scan 植物根系表型高通量分析測(cè)量系統(tǒng)是針對(duì)作物根系生長(zhǎng)特性和根系表型圖像采集需要,研發(fā)的可用于根系生長(zhǎng)可視化動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)系統(tǒng)。該根系表型系統(tǒng)空間利用率高,且設(shè)計(jì)了適用于根系表型圖像采集的專(zhuān)用傳感器,可實(shí)現(xiàn)作物根系表型圖像的無(wú)畸變、高分辨率及高質(zhì)量采集。

    其配套的根系表型分析軟件,支持輸入由根系掃描設(shè)備獲取的原始數(shù)據(jù)并自動(dòng)進(jìn)行預(yù)處理, 如去噪、圖像增強(qiáng)配準(zhǔn)等操作;采用先進(jìn)的深度學(xué)習(xí)算法,將根系圖像從背景中分離,以便后續(xù)根系提取和表型參數(shù)計(jì)算;而后從分割后的圖像中提取根系像素點(diǎn),用于計(jì)算如根長(zhǎng)、根粗、分支角度等指標(biāo)表型參數(shù)計(jì)算。

    系統(tǒng)簡(jiǎn)介

    該系統(tǒng)由培養(yǎng)模塊、運(yùn)輸模塊、檢測(cè)模塊、清洗模塊四部分構(gòu)成。平臺(tái)系統(tǒng)自帶可見(jiàn)光檢測(cè)設(shè)備,可拓展外接高光譜成像設(shè)備。系統(tǒng)還可達(dá)到以下要求:檢測(cè)速率50板/小時(shí); 數(shù)據(jù)提取精度>95%; 視距50cm處能達(dá)到1mm達(dá)到3-4像素。

    統(tǒng)平臺(tái)?意圖

    · 培養(yǎng)模塊:根盒放置于培養(yǎng)架,根盒底部設(shè)計(jì)特殊固定卡槽底座。目標(biāo)植株于根盒中培養(yǎng)生長(zhǎng)。根盒自身附帶特定標(biāo)簽,可通過(guò)軟件進(jìn)行精確追蹤,生長(zhǎng)周期采集數(shù)據(jù)電子入檔。

    · 運(yùn)輸模塊:運(yùn)輸推車(chē)底座配備特制夾取固定裝置, 能夠與根盒底部精準(zhǔn)匹配, 可將根盒從培養(yǎng)架運(yùn)輸至暗箱的傳動(dòng)裝置上, 隨后將根盒送至暗箱內(nèi)部進(jìn)行根盒標(biāo)簽掃描和根系部分?jǐn)?shù)據(jù)采集。

    · 檢測(cè)模塊:由暗箱、成像系統(tǒng)、微量土壤取樣模塊、內(nèi)置光源、固定系統(tǒng)、傳動(dòng)裝置組成,負(fù)責(zé)檢測(cè)目標(biāo)植株各項(xiàng)生理參數(shù)。微量土壤取樣模塊旨在實(shí)現(xiàn)植物根際微尺度范圍內(nèi)(約0-5mm)土壤或溶液樣品的無(wú)損、定量采集,用于根際分泌物、微生物群落及化學(xué)梯度的精細(xì)研究。傳動(dòng)裝置支持批量檢測(cè),可同時(shí)容納三板根盒。目標(biāo)植株檢測(cè)完成后,運(yùn)輸推車(chē)將根盒夾取并送回培養(yǎng)架原位;同時(shí),另一推車(chē)同步將待檢測(cè)的新根盒運(yùn)送至傳動(dòng)裝置,實(shí)現(xiàn)不間斷數(shù)據(jù)采集。

    · 清洗模塊:定期清潔維護(hù)根盒光學(xué)面板, 可通過(guò)特定裝置非人工夾取光學(xué)面板。

    軟件功能

    · 樣本編號(hào)智能管理

    該功能聚焦于樣本全生命周期的編號(hào)規(guī)范化與智能化管理,通過(guò)建立統(tǒng)一的編碼規(guī)則( 如包含樣本類(lèi)型、采集時(shí)間、處理批次等信息),實(shí)現(xiàn)樣本編號(hào)的自動(dòng)生成、關(guān)聯(lián)與溯源。支持批量導(dǎo)入導(dǎo)出、編號(hào)查重校驗(yàn)及樣本狀態(tài)實(shí)時(shí)更新, 可與后續(xù)表型分析環(huán)節(jié)無(wú)縫對(duì)接,尤其適用于多批次、多類(lèi)型樣本的規(guī)模化研究場(chǎng)景。

    · 根系形態(tài)特征提取

    基于圖像識(shí)別與深度學(xué)習(xí)技術(shù),對(duì)根系圖像(如掃描圖、顯微圖像等)進(jìn)行自動(dòng)化分析,精準(zhǔn)提取關(guān)鍵形態(tài)參數(shù)??勺R(shí)別直徑1mm以上根系,提取精度95%以上,并量化根系長(zhǎng)度、直徑、表面積、體積、分支數(shù)、根尖數(shù)量、交叉點(diǎn)數(shù)等特征,智能估算生物量,動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)根系生長(zhǎng)變化,解析生長(zhǎng)速率。突破傳統(tǒng)人工測(cè)量的主觀性和低效率限制。同時(shí)支持不同生長(zhǎng)階段根系形態(tài)的對(duì)比分析,廣泛應(yīng)用于作物育種、植物生理學(xué)研究等領(lǐng)域。

    · 表型參量統(tǒng)計(jì)及動(dòng)態(tài)分析

    整合樣本編號(hào)、根系形態(tài)、理化表型等多維度數(shù)據(jù),提供強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)分析與可視化功能。支持對(duì)單/多組樣本的表型參數(shù)進(jìn)行均值、方差、顯著性檢驗(yàn)( 如t檢驗(yàn)、ANOVA)等統(tǒng)計(jì)計(jì)算,同時(shí)通過(guò)折線圖、熱圖、動(dòng)態(tài)曲線等方式,直觀展?表型參數(shù)隨時(shí)間、環(huán)境或處理?xiàng)l件的變化趨勢(shì),揭?表型與基因型、環(huán)境因子的關(guān)聯(lián)。

    以上功能覆蓋了從樣本管理到表型數(shù)據(jù)獲取、分析的全流程,通過(guò)智能化技術(shù)提升植物表型研究的效率與精度,助力農(nóng)業(yè)育種、植物科學(xué)等領(lǐng)域的創(chuàng)新研究。

    軟件界面展?

    系統(tǒng)特點(diǎn)

    · 拓展性:可外接拓展高光譜成像設(shè)備;

    · 兼容性:可兼容多款高光譜儀器軟硬件操作;

    · 高透射率:根盒采用特制光學(xué)玻璃材料, 透射率達(dá)90%以上;

    · 自動(dòng)化:推車(chē)自帶根盒夾取裝置, 無(wú)需人工搬運(yùn);

    · 不間斷采集:根盒、運(yùn)輸推車(chē)、傳動(dòng)裝置配套配合,穩(wěn)定運(yùn)輸, 實(shí)現(xiàn)不間斷采集;

    · 全流程實(shí)時(shí)追蹤:根盒帶有固定編碼, 暗箱配套掃描裝置, 支持追蹤溯源, 實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定位;

    · 提取根系基本形態(tài)特征,還可實(shí)現(xiàn)多樣化根系表型參量統(tǒng)計(jì)及動(dòng)態(tài)分析;

    · 如有需要, 可獲取地下、地上部分全部圖像數(shù)據(jù)。

    培養(yǎng)模塊-根盒設(shè)備參數(shù)


    培養(yǎng)架?意圖

    · 長(zhǎng)度:100cm

    · 寬度:30cm

    · 厚度:5cm

    · 重量:20kg

    · 材質(zhì):不銹鋼 、特殊光學(xué)玻璃 .  面板透射率:90%

    · 面板易于拆卸,方便清洗與維護(hù)

    · 底部裝有排土孔、排水孔、固定卡槽

    · 根盒兩側(cè)均勻分布數(shù)個(gè)土壤取樣口 , 以實(shí)現(xiàn)對(duì)根系周?chē)寥廊?/span>

    · 溫度范圍:0℃-50℃

    根盒?意圖

    運(yùn)輸模塊-推車(chē)設(shè)備參數(shù)

    · 重量 :40kg

    · 電機(jī)步進(jìn)角: 1.8 °

    · 電壓: 3V

    · 通訊接口 : RS485 ,基于標(biāo)準(zhǔn)的Modbus RTU協(xié)議。

    · 運(yùn)動(dòng)方式: 扶手按壓前進(jìn)

    · 推車(chē)底座安裝有與根盒底座相匹配的特制夾取固定裝置。

    檢測(cè)模塊-設(shè)備參數(shù)

    可見(jiàn)光相機(jī)

    暗箱

    · 遮光率: >99%

    · 檢測(cè)速率: 50板/小時(shí)

    · 根系數(shù)據(jù)范圍: 視距50cm處能達(dá)到1mm達(dá)到3-4像素。

    · 自動(dòng)調(diào)節(jié)燈源

    · 兼容多款高光譜儀器軟硬件操作

    微量土壤取樣器

    · 無(wú)損采集根際土壤樣品 ,保留自然根-土界面結(jié)構(gòu)。 .  支持定點(diǎn) 、 多點(diǎn)或時(shí)間序列取樣。

    · 與液相色譜 、代謝組學(xué) 、 離子色譜等后續(xù)分析兼容。 .  可擴(kuò)展為自動(dòng)化多通道采樣系統(tǒng)。通過(guò)采集到的根際土壤樣品 , 結(jié)合后續(xù)分析手段( 如LC-MS 、 GC-MS 、 IC 、 ICP-MS 等), 可以得到如下參數(shù):

    · 可溶性有機(jī)物 (有機(jī)酸、氨基酸、糖類(lèi)、多酚類(lèi)等小分子代謝物);

    · 植物根際信號(hào)分子(黃酮、萜類(lèi)、苯丙素類(lèi)等);

    · 無(wú)機(jī)離子與營(yíng)養(yǎng)元素 (N、P、K、Ca、Mg、Fe、Mn等可溶態(tài)營(yíng)養(yǎng)離子濃度);

    · 根際pH 、 離子強(qiáng)度 、 電導(dǎo)率(EC)、氧化還原電位(Eh)……

    光源

    · 功率: 20W

    · 色溫: 6500K

    · 尺寸 : 1185.8*28.4*35.7(mm) .   防頻閃

    · 額定功率/電流: 20W/0 .09A

    · 光通量: 1800lm .  顯色指數(shù): >70


     

    清洗模塊-設(shè)備參數(shù)

    · 通過(guò)特制裝置非人工夾取光學(xué)面板

    · 特制清潔毛刷

    · 清洗完成可輔助根盒原位組裝

    · 水流固定不飛濺

    應(yīng)用領(lǐng)域

    使用該設(shè)備進(jìn)行大規(guī)模苜蓿群體全生育期根系表型監(jiān)測(cè) , 探究全生育期范圍內(nèi)根系表型對(duì)干旱 、 鹽堿等非生物脅迫的動(dòng)態(tài)響應(yīng)。

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